针对中医药科技发展前沿和医疗实践中的重大问题，聚焦于中药药理、中药毒理、中药药物代谢、中药分析等方向，建立一个旨在开展中医药防治重大疾病复方药筛选、中药治疗功效评价与作用机理研究，以确保中药的合理使用和安全性等研究的现代化综合性实验平台。中药功效与安全评价研究中心开展以下方向研究工作：
(一)以危害人民生命与健康、威胁我国公共安全的重大慢性疾病为研究重点，从分子、细胞、器官和整体动物水平研究其药理、毒理以及作用机理，研究和发现新药先导化合物，开展与中药研发相关的基础理论与创新技术研究；
(二)整合系统生物学、网络药理学、转录组学、蛋白组学代谢组学等多组学技术的优势，构建解析“中药复杂化学物质成分”、“多重药效靶标”的新型技术体系，创建中药“多成分-多靶点-多效应”的解析平台，实现中药干预重大慢性疾病的“分子网络药理活性-病证效应”多层次整合复杂作用机制的系统化与精细化解析；
(三)通过系统解析传统中药、已上市中成药、“经典名方”防治各种重大慢性疾病的化学成分、作用靶点、药效机制，建立适用于中药复杂作用解析的技术体系，建立基于药效循证、医学循证的创新中药组方优化方法等，系统解析中药的作用机制，促进相关中药的临床精准应用，为中药产业发展提供技术支撑，促进中药现代化与创新发展；
(四)对中药组成成分和药效等方面进行深入研究，同时重视中药的产地、生长环境、采收、加工等因素对中药质量的影响从而完善中药标准体系存在的不足；
(五)建设中药功效、安全性评价验证与应用示范性平台:包括中医药临床研究的数据管理中心，中医药临床研究质量控制平台，中医药特色的生物样本库等。
